Сумма контракта увеличивается на разницу в зп помноженную на оставшийся период действия. На эту сумму нужно доклеить марки. В налоговую принесёте доп. соглашение - они всё посчитают. Только закладывайте на это пару недель, у них допники могут долго штамповаться.