вы должны физически находится на Кипре и подать документы на рассмотрение внж (т.е. получить ресипт (квитанцию) за оплату этого рассмотрения)
когда эти два события совпадают, то начинается отчет легального нахождения на Кипре :)

нет конечно
если вы не подали на внж, то как может начаться ваш официальный отчет срока нахождения на Кипре именно как резидента, а не туриста?

это на entry permit?