не считается, для подсчета дней на Кипре (считают ночи).
но если в контексте визы "до 5го" числа, то нужно именно улететь 5го, а не 6го.
Поэтому, имхо, лететь 31го - уже плохая идея.

А если есть дальнейшие планы на Кипр, то я бы вообще не рисковал ,а летел даже 29го (вдруг отменят/перенесут рейс или еще чего-нибудь случится...)

Не видел. Это мнемоническое правило для запоминания

Смотря от куда и куда. Дело не в конкретной авиакомпании.
Кипр-Вена-Кипр - все отлично (как и ожидалось)
А вот Кипр-Чехия - не посадят 100%

При наличии шенгена не должно быть проблем

*через внешние границы шенгена

Да. (Из шенгена) Причем это не лайфак из-за того что границ толком нет.
А официальный способ (закон это не запрещает)
Вроде бы даже не могут не пустить, ибо это противоречит шенгенским соглашениям

Это когда у вас пятилетний загран без биометрии. Оно и раньше так было (не имеет отношения к рф запретам)