ему нужно оформить видимо MEU1 (но тут лучше уточнить в миграции). подаете документы, сразу дадут так называемый жълт лист и это и будет его вид на жительство, пластик не дают в этом случае.
но уточните в миграции как несовершеннолетнему гражданину ЕС оформлять, идите в окна для граждан ЕС.

p.s. граждане ЕС могут 4 месяца находится без оформления вида на жительство, потом если хочет пребывать дальше, нужно оформить.

в РФ для целей НДФЛ не применяется понятие центр жизненных интересов.
обратной стороной неприятной, что везде не резидент, может быть, что налоги в каждой из стран проживания могут захотеть с человека как с нерезидента. но это мое предположение.

вам нужно к налоговому консультанту, чат в вашем вопросе вам не поможет.

я не являюсь налоговым консультантом по налогам Кипра, поэтому не подскажу.