Ну у них же работает прописать возврат и его условия и не возвращать потом 🤷♀ Но в целом, при депозитах больше одного, я бы настаивала на зачёте по последние месяцы всего, что выше одного депозита.
Два года назад прямых перелётов на Кипр так же не было, и то что в Шереметьево вас выпустили из страны в безвизовую точку пересадки не имеет никакого отношения к визе. Скорее всего вы не летели в тот раз в визовую страну, потому что вас бы туда просто не запустили с визой, ещё не действующей на момент въезда.