TD38 надо подать. В вашем случае, видимо, придется пойти в налоговую.

Доходы на которые 30% в РФ платили, где получали?

Странно. Если доход получен до н.резидентсва могли вообще его не писать. Теперь придется возражения подавать, либо самому, либо через аудиторов/бухгалтеров. Не уверен, но предполагаю, что декларация была с ошибками заполнена..

Надо идти в налоговую, тогда и/или уходить от этого бухгалтера.