Не будут, летаю со своим сыном с разными фамилиями двенадцатый год на Кипр, в том числе разными вариантами транзитов. Доверенность от папы требуется только для получения визы в консульстве.
На границе требуется свидетельство о рождении обязательно. Всё.
Через Каир летели в прошлом августе, всё ок, также как и везде никаких вопросов 🙂