Речь же была про сам номер, а не про то, что их одновременно делают.
VAT id отдельно оформляется, обычно после первой продажи чего либо с ним подают отдельную форму.
После его получения дают 3 месяца до даты присвоения номера, чтобы учесть бухгалтеру все что пришло и ушло с VAT по инвойсам до получения номера и 3 месяца после.
Я думаю несколько последних лет делают одинаковые номера, наверняка начали после того как Кипр присоединился к этой системе.