Ребёнок физически сейчас где, на Кипре? По опыту знакомых, аннуляция пермитов не проходит автоматом в связи с отсутствием в стране, ее инициирует пограничник при попытке въезда с нарушением срока (отсутствие >90 дней). Если он этого не сделал, пермит останется действующим, несмотря на длительное отсутствие.