Все верно, осмотр теперь не ставят в европаспорт в раздел клинического осмотра, но осмотр в целом не нужен для возвращения животного в ЕС/на Кипр. Но, если очень хочется, можно поставить отметку об осмотре в раздел "Другое/Other", это не запрещено. Плюс стоит обратить внимание на то, где были сданы ваши титры - от этого зависит, нужно ли вам ещё оформлять евросправку даже при наличии европаспорта.

Здесь можно почитать статью о возвращении из нашего закрепа: https://t.me/cyanimals/208034

А вот ещё статья из "Увожу кроликов" на ту же тему:
https://t.me/takemyrabbits/537466?single

Колеса, считай, лишний аксессуар, если вы не собираетесь катать переноску вне аэропорта. Перед полетом их нужно обязательно снимать, что требует определенной сноровки. А по аэропорту гораздо удобнее катить ее на грузовой тележке

Обратите ещё внимание на то, что Скудо 7 не очень надёжный вариант для большой собаки, пластик хрупкий и легко разгрызается: https://rabbitsleavingrussia.wiki/w/%D0%9F%D0%B5%D1%80%D0%B5%D0%BD%D0%BE%D1%81%D0%BA%D0%B0#%D0%9F%D0%B5%D1%80%D0%B5%D0%BD%D0%BE%D1%81%D0%BA%D0%B0_%D0%B4%D0%BB%D1%8F_%D0%B1%D0%B0%D0%B3%D0%B0%D0%B6%D0%B0:_%D0%BA%D0%B0%D0%BA_%D0%B2%D1%8B%D0%B1%D1%80%D0%B0%D1%82%D1%8C_%D0%B8_%D1%87%D1%82%D0%BE_%D0%B5%D1%89%D1%91_%D0%BD%D1%83%D0%B6%D0%BD%D0%BE_%D0%B7%D0%BD%D0%B0%D1%82%D1%8C. Лучше что-то другое присмотреть

Если вы из другой страны ЕС с европаспортом (а в нем вакцинация от бешенства, проведенная на территории ЕС), то просто идете через таможенников - они проверят ветпаспорт. Уведомлять ветслужбу не нужно при таких вводных