Это абсолютно нелегально. Не оплачиваемый отпуск без отчислений в si и пр. расценивается миграцией как нелегальное пребывание. Отчисления с зп должны быть до даты терминейш. Вам повезло, что миграция приняла документы, но при подаче на гражданство по выпискам будет виден разрыв в выплатах