Тот факт, что технически VAT-номер именно так и выглядит (номер VAT = CY+TIN) не делает его VAT-номером автоматически. Без процедуры регистрации VAT этот номер не пройдет проверку.
А почему они должны плохо отнестись? Мне лично ВоС сам предлагал открыть личный счёт, прекрасно зная, что у меня есть личный в бывшем Хелленике. По идее для них это значит, что как минимум один банк уже считает вас нормальным клиентом