Писали, что можно попробовать получить сначала по копии справки кипрское, а потом российское по оригиналу. Не у всех получалось и люди получали по оригиналу справки кипрское свидетельство, а потом на основании него оформляли гражданство РФ и паспорт. Вам надо идти строго в тот муниципалитет где рожали, в Никосии СОР по копии из лимасольской клиники не выдавали и раньше. "Решайте вопрос в Лимасоле" говорили в Никосии. В Лимасоле зависит от сотрудника на которого попадете. Через сколько дней после рождения вы получили СОР РФ и через сколько за кипрским пошли? Возможно, что вы затянули с получением кипрского СОР и это стало основной причиной отказа регистрации по копии.

Ух, и сложная у вас история. Сходите в муниципалитет к начальнику отдела регистраций и попробуйте объясниться. Скажите, что в стрессе допустили ошибку, а теперь не можете назад отмотать и исправить, но готовы на любые бюрократические процедуры. Решение наверняка есть, но придется постараться.

Скорее всего через заявление в полицию об утере/утрате и восстановление/получение новой справки, как это бывает с любыми важными документами, водительским удостоверением или паспортом, например. Сообщать заведомо ложные сведения – это углублять яму в которой и так уже оказались. Одно дело реально утратить, а другое – использовать. В этом случае шило в мешке не утаишь.