технически нет ограничений. можете раз в 3 месяца на пару дней на планёрку прилетать, особенно если в трудовом есть пункт про возможность удалённой работы. Просто другого характера вопросы могут возникнуть потенциально. Банки ЕС/Швейцарии такое "резидентство" не особо любят, например

Вы путаете с налоговым резидентством по правилу 60 дней. И там всё несколько сложней. Ищите 60 days rule Cyprus tax residency, либо в закрепе по налогам.