Если вы гражданин государства, визу для въезда в это государство вам не дадут: она вам не нужна.
Но получение письма с положительным решением по вашему запросу о предоставлении гражданства не делает вас гражданином автоматически. Вы не являетесь гражданином Республики Кипр как минимум до подписания вами присяги на обороте формы M128 в суде (а по-хорошему, вы еще один экземпляр в Civil Registry должны вернуть и вам ваш персональный идентификационный номер присвоят).
По вашему вопросу: въезжайте (возвращайтесь) по вашему действующему пермиту спокойно и уже на месте проходите все необходимые формальности в рабочем порядке.

Сертификат о натурализации.

Это форма заявления на натурализацию (предоставление гражданства) по критерию прожитых лет.

Этих форм - тьма тьмущая (ну, немало). И заявления, и результаты этих заявлений...
Реально в этой теме -
M125 - заявление на предоставление гражданства по регистрации по браку
М126 - "по родителю" (ребёнок киприота)
M127 - по сроку проживания
M128 - сертификат о натурализации
M140 - сертификат о натурализации
Остальное весьма специфично.