С Кипра человек не может получать доход как физлицо, если компания присылает доход с кипрских счетов.
А так - или сообщать бухалтерии на работе о том что есть доп доходы, или узнавать у бухалтерии какая у него ставка и самому доплачивать сверх прогрессивки + геси