А такой вопрос, если до этого была скидка в 20% (переход на 50% был на транзитных условиях), но за отчетный год ЗП<55k то можно ли применить 20% скидку или ставить уже обычный код дохода (без каких либо скидок)?

Если ваша декларация еще не в статусе Accepted, вы можете ее отозвать, исправить и засабмитить снова.