В любом случае это ваши личные налоги и ваша личная ответственность за сумму, а разбор полётов - ну смотря что значит "неправильно". Вы должны были подать форму TD59 при найме/в начале года, где заявляли свои вычеты. Бухгалтерия должна применять их согласно вашему заявлению.

Если по факту за первый год получилось больше 55к и всем остальным условиям соответствовать - можно заявить вычет в годовой декларации и через 3-5 лет получить возврат от налоговой. И дальше применять его.