Интересно еще, как будет трактоваться, если в течение одного из лет резидентства на Кипре аппликант в сумме провел больше 90 дней в году за пределами Кипра (но каждая поездка была меньше 90 дней)

Я вижу 3 варианта
1. Не будут учитываться только те дни, которые превышают 90 (то есть, если провел 100 дней за рубежом, то нужно будет подаваться на 10 дней позже)
2. Не будут учитываться все дни за рубежом в данном году (подаваться на 100 дней позже)
3. Вообще весь год не будет учитываться (маловероятно, но при желании может быть и такая трактовка)