Если будете подаваться на рос.паспорта, все равно надо выехать и по ним въехать, а далее, надеюсь, у миграции на будет вопросов. По мне так второй вариант лучше
Да, но главное, по какому паспорту въезжаете, по дому и подаетесь. Во втором варианте вы хотя бы не путаете миграцию, просто предъявляете новый документ той же страны