Внутри Шенгена нет пограничного контроля. Кто не пустил? Авиакомпания?

Ну, это «вахтёрство», его никто не отменял. От себя рекомендую Вам полететь в Вену, а оттуда на поезде в Прагу. Мы так с сыном путешествовали несколько месяцев назад.

Неверная информация. Внутри шенгена такого правила нет. Подруга из Парижа в Прагу летела на прошлой неделе. Никаких проблем. Авиакомпания Рианэйр. До самого трапа никто документов не проверял. На посадке сверили фамилию в паспорте и посадочном. Другой момент, что если с Кипра в Прагу надо, то быстрее через соседнюю страну наземным транспортом, не нужно закладывать промежутки на пересадки, и перемещение в аэропорт "заранее". Из Вены в Прагу поезд идёт 4-5 часов, выход в центре города сразу.