Раньше было правило, что каждый год налогооблагаемая сумма уменьшается на 18к евро, в случае роста цены квартиры. То есть, по старым правилам, не более чем с 80К прибыли, если таковая имеется , после 5 лет владения платить ничего не надо было. Как сейчас - не понятно. Самое простое - сходить в налоговую ногами и спросить. Они вполне сговорчивые, в Лимассоле, во всяком случае. Но, думаю, у вас налога не должно быть при продаже.
С налоговой на Кипре можно торговаться. Если ест какие квитанции за всякие кондиционеры или солнечные батареи - смело их приглашайте к делу. Налогооблагаемую базу снизят.