А квартиру на Кипре за наличные из РФ купить можно или Council of Ministers разрешение на такое не выдаёт? Там вроде запрашивают в сопровождающих документах "Documents indicating the financial position of the applicants" (Form Comm. 145)

Формально вроде бы на Кипре нет никаких ограничений: https://www.europe-consommateurs.eu/en/shopping-internet/cash-payment-limitations.html

€10.000 - это со стороны банков, они отказываются выдавать наличку больше этой суммы, да. Но если уже, допустим, на руках будет наличка - то где написано, что нельзя её положить в карман продавцу квартиры? Земельному департаменту наверное наплевать, вопросы скорее всего могут возникнуть при получении разрешения на покупку?

Но transfer fee довольно низкий, калькулятор показывает, что до €300к этот налог остаётся в пределах десятки

Вроде в рублях вывозить можно без ограничений 😁 А на перевалочном пункте поменять.

У вас есть ссылка на первоисточник? Я вижу только ограничение на иностранную валюту:

https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_410578/#dst100016

ж) запретить со 2 марта 2022 г. вывоз из Российской Федерации наличной иностранной валюты и (или) денежных инструментов в иностранной валюте в сумме, превышающей эквивалент 10 тыс. долларов США и рассчитанной по официальному курсу Центрального банка Российской Федерации, установленному на дату вывоза.

Почитайте новости, киприоты только и делают что в наличке сбережения хранят. Постоянно сообщения о том, что грабители вынесли десятки тысяч из дома. Так что есть люди, которые нормально относятся к купюрам. Это их дело, как они ими распоряжаются. Может тоже в серую что-то покупают. Или делят по кусочкам между детьми. Или живут на них. Вариантов много.

Речь идёт о скромной квартире, какая-нибудь вторичка, в районе сотни

А что указывали при получении разрешения (форма 145)? Там надо описать Ваше финансовое положение. У меня знакомый интересуется, который на Кипр ещё только собирается. Ему значит просто прикрепить выписки по российским счетам и таможенные декларации?