Но в шенгенскую зону влететь лучше через Италию, а потом уже внутри Шенгена въехать в Швейцарию (без паспортного контроля в Швейцарии). На прямую в Цюрих с ларнаки конечно удобно, но не с паспортом РФ.

Проблем нет, но есть ненулевая вероятность нарваться на вахтёров которые возбудяться от РФ паспорта