Это исключение (чудо по статистике наших HR 4 кейса из 1000) и не обязательно связано с предъявлением пермита. Пермит ребенка действует и по нему уже летали. Надо ли показывать пермит одновременно с визой, думаю да, так вы узнаете действует он или нет (лучше чем неопределённость при следующем пересечение границы или подаче документов).