Gross - сумма в контакте. И дальше обе стороны платят с неё свои налоги.

Общепринято во всех странах со сложной налоговой системой. Работодателя не касаются налоги сотрудника, его вычеты, совместная подача с супругом/ой и т.д. Равно как и сотруднику не интересно какие налоги, льготы и режимы у компании. Точка отсчёта - сумма в контракте.

Технически налоговым агентом выступает компания и платит в бюджеты она по поручению сотрудника. Форма TD59 на Кипре. Это налоги, заплаченные из кармана человека, и дальше он сам подаёт финально декларацию и разбирается с налоговой по всем вопросам.

Обо всём этом можно прочесть в закрепе.

Да, можно. В закрепе.