На сайте консульства Кипра (я смотрела СПб) есть калькулятор пребывания, там есть нюансы по подсчётам, так что если сроки близки к максимальным, рекомендую воспользоваться или хотя бы погуглить. Даже один день нарушения приравнивается к нарушению визового режима.