Но 90 дней отсутствия - это же про единоразовое отсутствие (не более 90 дней подряд), а не суммарно в год.
Или я что-то не правильно поняла сама?

Тут в чате есть кейс выше - за просроченную визу чувак попал в тюрьму + стоп-лист на 10 лет (ищется по слову "тюрьма")
Достаточно наглядно?)

Кто-кто, а пограничники точно не будут кропотливо считать дни отсутствия по всем штампам)
Если прилетит - то как написано в документе - уже уведомление от мигрейшна за две недели.

Может имеет смысл написать письмо в какие-то органы (мигрейшн?) и попросить более точную формулировку с подписью и печатью?)
И вам официальный документ, и в чат на всякий случай скинете потом)