Как и где ставить апостиль определяется страной выдачи документа.
В РФ на свидетельства о рождении и браке в архивных отделах ЗАГС, МИД не имеет к этим документам отношения.
Мало того - в РФ для Кипра апостиль ставить откажутся (не нужен), говорите что для Греции.