Если рейс транзитный и вы не выходите за багажом и тд - не ставят.

Время пересадки на это не влияет, влияет только выходите ли вы за зону паспортного контроля или нет.
Вы как летите?

По идее если у вас москва-стамбул-милан одной авиакомпанией и "одним билетом" - то рейс будет транзитный и за багажом вам выходить за паспортный контроль не нужно будет, даже если длинная пересадка.
А чем так плох штамп турции, кстати?

++++
(к допросу не по политическим мотивам)