Две авиакомпании, которые не имеют между собой договоренностей. Не может там быть никакого транзита. Паспортный контроль четыре раза проходить надо, вылет-прилет и опять вылет-прилет. Границу пересекаете четыре раза, поскольку в Ереване проходите регистрацию на стойке уже на территории Армении, а не в чистой зоне. Платили вы скорее всего за отсутствие электронной регистрации на рейс или за отсутствие распечатанного посадочного талона. Обе авиакомпании страдают такими дополнительными сборами. Их можно избежать.
Последний мой рейс FLYONE из Новосибирска в Ереван задержали на 16 часов. WizzAir задерживался максимум на час, может мне везло.
По опыту, в Ереване надо всегда брать запас сутки в случае обратного полета из России замечательной авиакомпанией FLYONE