Диарея и рахитичный живот может быть от короны,паразитов включая простейших.

Кастрирован?

Так кот кастрирован или нет?

Квартира новая? Или в ней жили до вас другие коты? Или у соседей есть коты за стенкой?
Был кейс,когда кот начал метить, везде. По итогу оказалось,что до них в квартире жили коты,и новому жильцу нужно было обязательно утвердить себя теперь я а территории)

Как версия,запахи уличных котов его напрягают. У меня такая же фигня,входную дверь изнутри регулярно обновляли метками мои кастрированные коты.
И для вашего пацана это важно,он свою территорию защищает,против природы не пойдешь)

Я переехала.
Ещё вариант выводить его гулять во двор,на шлейке,пусть там кусты все пометит,а дом не трогает