Документы проверяют на этапе до полёта, то есть все собираешь и отправляешь в бен гурион, если что то не так или досылаешь или отказ. Без разрешения бен гуриона животное на борт не посадят.

https://t.me/israel_with_pets тут много информации про ввоз животных в израиль