Вам нужно ещё у ветеринара в аэропорту поставить печать на этот сертификат.

Если у вас есть сертификат, форма уже не нужна.
Вам ветеринар выдал форму4 или 5 и вы её обменяли на сертификат. Для въезда вам больше ничего не нужно. Только печать в аэропорту ещё поставьте

Ну вот дополнительную ставили, мы сертификат получали в спб, возможно из-за этого

Есть какой-то срок его действия.

90 дней точно, возможно и больше.

Нам сказали по нему можно вернуться в Россию в течении определенного времени

Видимо да, вы правы.