Кисточкой\валиком, как удобно.
Но под это это покрытие нужно все хорошо вычищать, трещины заделывать, просушивать (сезон уже немного не тот м.б. в скоре).

А по поводу алю.подоконников...
Это самая надёжная схема, но сложнее, чем намазать мембрану..
Мне тоже нужно было сверху прикрыть балки..метров 25. я покупал алю лист, распускал по размерам, загибал бортик.
Но это оснастку пришлось кастомить из подшипников, чтоб края прокатывать, чтоб аккуратно загнулись.

Там не д.б. толщины. Она относительно тонкая, как обычная краска. Не должна стекать.
В т.ч она в несколько слоев мажется

И да, там грунт ещё нужен соотв.

Именно в трубке от кондея часто и засоряется.
1. Обычно гофра, а не гладкая.
2. Говна в трее кондея часто собираются, если его долго не чистили или чистили не полностью. Они забивают трубку.
3. Если есть провисания типа U..
Именно тогда течет с кондея, а не по стене.

А трей в стене и дальше трубка могут засоряться, если не отсоединяют гофру от трея кондея, когда его чистят...
Вся живность попадает в трей в стене и там плодится\размножается